功能樹（function tree）是在複雜系統中的樹狀示意圖，說明系統各功能的相依關係。功能樹可以將問題或其解答分析為較小的部份。在經濟學或是社會學中，也會用功能樹說明各過程之間的相依關係。若以程式實作的觀點來看，功能樹會繪出各函式分別呼叫了哪些函式。
功能樹常用來表示各流程的功能相依程度。功能樹也可以用在軟體工程上，不過軟體工程一般會用更準確的表示方式，也就是UML中定義的圖表。
