海軍總司令部（德語：Oberkommando der Marine，常縮寫為「OKM」）是存在於1859年至1871年期間的普魯士皇家海軍最高指揮機關。
在「普魯士戰爭部」部長阿德爾伯特親王（德语：Adalbert von Preußen (1811–1873)）的主導下建立了德國人的第一支現代化海軍，並於1859年3月14日將統帥權分離成「海軍總司令部」以及直屬普魯士國王的「海軍局（德语：Marineministerium (Deutschland)）」。在德意志帝國建立後，普魯士王國的「海軍總司令部」被併入帝國中央的「帝國海軍部」，其權力分給了後者和「海軍總監（德语：Generalinspekteur der Marine）」。
前後共兩任海軍總司令：