抑制消減雜交
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消減雜交(英語:Subtractive hybridization)這項技術可使對照組(驅趕子)與試驗轉錄物組cDNA片段中僅不相同的部分得到PCR擴增。轉錄物相對豐度的差異就被突出顯示,例如不同物種間的遺傳學差異。此項技術基於:對照品與試樣間雜交而形成的雙鏈DNA(dsDNA)被移除,因此消除了cDNA或gDNA中豐度相似的部分,僅剩下差異表達或序列、轉錄物或基因組序列有變異的部分。
抑制消減雜交(英語:suppression subtractive hybridization,簡稱為SSH)亦成功地被用於鑑定品系或物種間的DNA序列差異,包括弧菌屬等多種細菌。
另見
[編輯]外部連結
[編輯]- Overview at evrogen.com (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館)
- Munir, Shirin; Singh, Sushmita; Kaur, Kuljeet; Kapur, Vivek. Suppression subtractive hybridization coupled with microarray analysis to examine differential expression of genes in virus infected cells. Biological Procedures Online. 2004-01, 6 (1): 94–104. ISSN 1480-9222. PMC 420231 . PMID 15181476. doi:10.1251/bpo77 (英語).
- Diatchenko, L.; Lau, Y. F.; Campbell, A. P.; Chenchik, A.; Moqadam, F.; Huang, B.; Lukyanov, S.; Lukyanov, K.; Gurskaya, N. Suppression subtractive hybridization: a method for generating differentially regulated or tissue-specific cDNA probes and libraries.. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1996-06-11, 93 (12): 6025–6030. ISSN 0027-8424. PMC 39182 . PMID 8650213. doi:10.1073/pnas.93.12.6025 (英語).
- Galbraith, Elizabeth A.; Antonopoulos, Dionysios A.; White, Bryan A. Suppressive subtractive hybridization as a tool for identifying genetic diversity in an environmental metagenome: the rumen as a model. Environmental Microbiology. 2004-09, 6 (9): 928–937. ISSN 1462-2912. PMID 15305918. doi:10.1111/j.1462-2920.2004.00575.x (英語).
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